De omvangrijke en gevarieerde verzameling bestaat uit archiefdocumenten, egodocumenten foto's, filmmateriaal, voorwerpen, pamfletten, brochures, boeken, tijdschriften en kranten uit de oorlogsjaren en de bevrijdingsperiode, maar ook uit de tijd daarvoor en daarna. Geografisch ligt het zwaartepunt in Zwolle en de regio West-Overijssel, maar er zijn ook stukken aanwezig uit andere plaatsen en regioās in Nederland. Om het materiaal te beheren is op 10 februari 1995 de Stichting Collectie Zwolle 1940-1945 opgericht.
De collectie belicht uiteenlopende aspecten van de Tweede Wereldoorlog en werpt onder meer licht op de lotgevallen van tientallen individuen uit collaboratie en verzet, slachtoffers van de holocaust en van oorlogshandelingen, Duitse en geallieerde militairen, maar ook op de rol van organisaties als de NSB, het Nationaal Front, de Nederlandse Unie, de politie, de arbeidsinzet, de distributie en de luchtbeschermingsdienst. De Duitse en geallieerde propaganda en het dagelijks leven komen eveneens aan bod. De collectie wordt onder meer gebruikt voor tentoonstellingen, educatie, onderzoek van persoonlijke geschiedenissen, schrijven van werkstukken, wetenschappelijke studies, het plaatsen van gedenktekens, de verlening van Yad Vashem onderscheidingen, enzovoorts.
Om de slechts in beperkte mate beschreven collectie en de daarin opgeslagen informatie nader te ontsluiten heeft het Ministerie van Volksgezondheid, Welzijn en Sport in 2009 in het kader van het programma Erfgoed van de Oorlog aan het HCO een subsidie verstrekt. Jan ten Hove is vervolgens als externe projectmedewerker aangetrokken om de collectie te inventariseren en te catalogiseren.
Onder Persoonlijke stukken vallen hoofdzakelijk documenten en voorwerpen die op individuen betrekking hebben. Zo zijn in de rubriek Personen en families persoonlijke verzamelingen opgenomen van merendeels authentieke stukken, die niet alleen betrekking hebben op verzetsmensen, Joden en leden van de NSB, maar ook op āgewoneā mensen. Daarbij gaat het vaak om een mengeling van officiĆ«le documenten, aantekeningen, pamfletten, illegale publicaties, distributiebescheiden, correspondentie, fotoās en voorwerpen. Dagboeken, brieven, herinneringen en verhalen, en foto- plak- en aantekenboeken, die geen onderdeel uitmaken van een persoonlijke verzameling, zijn in aparte rubrieken ondergebracht en op naam geordend.
Onder Overige archieven zijn authentieke documenten van niet-persoonlijke aard ondergebracht die als een apart archiefje kunnen worden beschouwd.
Onder de hoofdrubriek Themaās zijn archivalia, brochures, pamfletten en voorwerpen gerangschikt op onderwerpen, zoals politieke bewegingen en partijen, oorlogsvoering, propaganda, Koninklijk Huis, bestuur, illegaliteit, Jodenvervolging, kerkelijke organisaties en godsdienst, nationaal-socialistische organisaties, economie en arbeid, dagelijks leven, cultuur, media en sport, gedichten, liederen en spotprenten, nasleep, politieke verhoudingen na de oorlog, herdenking en monumenten, en Nederlands-IndiĆ«. Deze onderwerpen zijn in veel gevallen weer onderverdeeld in sub-rubrieken.
Bijna alle in deze inventaris beschreven stukken zijn openbaar. Slechts enkele stukken worden niet zonder meer ter inzage gegeven om de privacy van nog levende personen te beschermen. In voorkomende gevallen wordt dit bij het catalogusnummer vermeld.